男性生殖器畸形包括很多有的先天性畸形只影响生育力，如单纯性输精管缺如;而有的还可能影响到性功能。有些畸形看上去并不严重如包茎，但处理不当同样能造成严重后果。
病状体征
一睾丸畸形
数量异常：
(1)无睾症罕见大概由于胚胎发育期某些原因造成睾丸分化不完全于是睾丸萎缩变性但因尚存部分间质细胞所以患者。可有男性外生殖器和外貌要注意与双侧隐睾症鉴别本症特点为血中黄体生成素(LH)增高给绒毛膜促性腺激素后血浆睾酮水平不升高。青春期后应规律性给予雄激素否则会出现类宦官综合征可进行睾丸移植手术采用同胞兄弟或异体睾丸移植本症多合并输精管附睾缺失。
(2)单睾丸大多不需特殊治疗手术检查的目的是为了找出可能存在于腹腔内的隐睾以防癌变。
(3)多睾丸指出现3个或更多的睾丸大小异常：
(4)睾丸由于发育不全而小于正常者多非孤立症状。
(5)睾丸由于增生变大如睾丸畸胎瘤。
(6)先天萎缩位置异常：
(7)睾丸融合指两侧睾丸在腹腔内或阴囊内融合为一体容易被误认为隐睾或单睾症多合并肾脏畸形。
(8)隐睾症
(9)异位睾丸
(10)睾丸附睾附着异常可使精子通过产生障碍造成不育二者连接不好很容易发生睾丸扭转甚至因供血不全造成组织坏死。
二输精管畸形
可分为先天性缺失与输尿管相交通及重复输精管等多种情形。
如果不并发其他畸形只是单纯性输精管缺，如时病人性欲和性功能均正常唯一症状是不育临床表现为无精症但血清激素水平均正常。可经睾丸活组织检查证实如有可能可行手术治疗将输精管残端与附睾进行吻合。
三阴茎异常
可分为大小异常及位置异常多与其他畸形同时出现，
(1)阴茎完全缺失多合并尿道畸形治疗相当困难过去施行阴茎成形术效果不好最好切除睾丸作尿道阴道成形术青春期后以雌激素维持女性性征。
(2)潜伏阴茎因发育短小而被会阴阴囊耻骨等处的脂肪所掩盖随着发育过程中脂肪减少阴茎才暴露出来也可以通过整形手术把阴茎“解放“出来就能恢复正常了。
(3)先天性阴茎扭转阴茎扭转时尿道口方向改变少数人可有勃起时的隐痛等症状本症还容易合并异常勃起。
(4)双阴茎可平行排列或前后排列。
(5)阴茎过大或过小罕见过大时可作整形术截短过小的病因复杂需针对病因适当处理。
(6)包茎可占男孩的25%以上但成年人包茎明显少于青少年可分为生理性包茎假性包茎(包皮过长)真性包茎和嵌顿包茎。
如果包皮与龟头粘连或包皮有横向走行的血管或包茎严重而从不翻起清洗的话都可能限制龟头的发育甚至出现包皮垢与尿中沉淀物细菌等构成的硬疙瘩。
(7)尿道上裂和下裂后者多见前者少见可影响勃起功能。
四前列腺精囊腺先天畸形。
(1)前列腺发育不全多与其他性 器官发育不全合并存在前列腺囊肿可并发排尿困难。
(2)精囊腺缺如合并不育症可由精浆果糖水平极低和精液量少作出初步判断并根据输精管精囊腺造影术确诊。